执教以来，杨圣奇教授始终秉持立德树人初心，躬耕不辍，育人成果显著。截至目前，已累计培养研究生56名（其中博士18名）。其团队政治素养过硬，研究生党员比例超过85%，1人获校级优秀研究生共产党员标兵，3人获评省级土木工程专业优秀毕业生。在他的悉心指导下，研究生获国家奖学金8人次、省优秀博士/硕士学位论文4篇；研究生作为主要完成人，获教育部自然科学一等奖1项、省自然科学二等奖1项；12名研究生成功获得国家留学基金委资助，赴海外知名高校深造。研究生以第一作者身份发表SCI/EI论文96篇，展现出强劲的科研创新能力。毕业生发展态势良好，示范效应突出。18名毕业博士已成长为高校博士生导师、国家博士后创新人才等科研骨干力量。38名毕业硕士中，11人选择继续攻读博士学位，8人考取选调生投身公共服务，另有19人进入中国建筑第八工程局等大型国企，成为关键技术人才。2025年荣获浙江省优秀研究生指导教师。

长期从事深部岩体灾变机理与地下工程安全控制方面的研究，主持1项深地国家科技重大专项课题、3项国家自然科学基金面上项目、1项国家重点基础研究发展计划项目973骨干、江苏省杰青项目以及江苏省国际科技合作/港澳台科技合作计划重点项目等10余项省部级及以上纵向项目研究工作。承担福建华东岩土工程有限公司、中铁二十局集团第四工程有限公司、山西保利铁新煤业有限公司、山西煤炭运销集团锦瑞煤业有限公司、晋煤集团赵庄煤业有限责任公司赵庄二号井等委托的20余项工程横向项目。解决了多项国家重大工程的地下空间稳定性评价、灾变预测与安全控制难题，产生了显著的经济和社会效益，为我国深地工程安全建设做出了直接贡献。

以独著身份出版英文专著2部、中文专著1部；在Engineering Geology等国内外权威期刊上发表论文300余篇，其中以第一或通讯作者发表SCI论文159篇（JCR一区122篇）；EI收录64篇，其中3篇入选领跑者F5000。成果获江苏省科学技术二等奖1项（R1），教育部自然科学一等奖2项（R2、R5），重庆市自然科学一等奖（R2），教育部科技进步二等奖（R3）等。授权美国、澳大利亚等国际发明专利5件（3件第1），国内发明专利34件（13件第1）。